Rozdíl mezi monokrystalickým a polykrystalickým panelem je v odlišném způsobu výroby jednotlivých článků. Tím vzniká především jiný vzhled jednotlivých článků, který můžeme na první pohled pozorovat a také trochu odlišné vlastnosti. Monokrystalický panel má tmavě modrou až černou barvu. Polykrystalický panel má modrou barvu a jsou v něm viditelné přechody mezi krystaly. Drobné rozdíly jsou ve výkonu za různých světelných podmínek. Monokrystalický je výkonnější a účinnější při přímém osvitu sluncem (např. v létě) o cca 1-2%. Polykrystalický má vyšší účinnost při obloze pod mrakem o cca 1%. V celkovém součtu v rámci celého roku pro naší zeměpisnou polohu jsou si oba rovni.